A ninja teknősöknek nagyon komoly ellensége van. A neve Savanti Romero. Ez a gazember időgépet épített, és most összegyűjti szörnyet az összes világról: a múltról és a jövőről, hogy egy hatalmas gazembercsapatká alakítsa őket. A hősöknek meg kell akadályozniuk az ellenség terveit. Ehhez meg kell látogatnia minden olyan helyet, ahol Romero meg akar menni, és semlegesíteni mindenkit, aki megpróbálja átállni az oldalára. Mike, Raphael, Leo és Donald készen állnak a veszélyes utazásokra. Meg kell választani az első pár pályázót, ők fogják át az ókori Egyiptomba. Ott találkoznak a gonosz múmiákkal. Drakula és a zombik várják őket a játék más, nem kevésbé veszélyes helyein Teenage Mutant Ninja Turtles Monsters Vs Mutants