A New York-i összeomlott valós fenyegetést formájában egy erős iratmegsemmisítő. Azt is meg kell venni a város percek alatt, de van, hogy megállítsa együtt Mutant Ninja Turtles. Ezek a bátor fiúk készen állnak bármilyen nehézséget, hogy megmentse a szülővárosa a téboly. Mindegyik karakter lesz a saját küldetése, célja, valakinek, hogy készítsen egy bájitalt, hogy elpusztítsa a mutáns valaki lő le rakétavető, és valaki, hogy legyőzze az ellenséget közelharcban. Minden teknősök lesz csak három kísérlet, ha veszít, a város esne.