Egy olyan világban, ahol intelligens állatok élnek, új kórház nyílt a fővárosban. Ennek élén egy Tom nevű kedves pandadoktor áll. Ma fogadóórát tart, és Ön a Animal Doctor Best Doctor játékban segít neki a munkájának elvégzésében. A képernyőn előtted meglátod azt a csarnokot, amelyben a látogatók lesznek. Az egérrel kattintva válassza ki az első beteget, aki az irodájában lesz. Először is különféle orvosi műszerek segítségével meg kell vizsgálnia a beteget annak diagnosztizálása érdekében. Ha bármilyen problémája van ezzel, van egy segítség a játékban, amely megmutatja a műveletek sorrendjét. A diagnózis felállítása után kúrát fog végezni gyógyszerek segítségével. Ha végzett, a beteg újra teljesen egészséges lesz, és továbbléphet a következő látogatóhoz.