A játékvilágban minden felborult. Az egykor békés Gomba Királyságban, ahol mindig nyugodt volt, és csak gombák vagy teknősök tudtak csínytevésre, valóban veszélyes ellenségek kezdtek megjelenni - ezek zombik. Nem először fordult elő, hogy Mariónak erőteljes fegyvert kellett vennie ahhoz, hogy ellenálljon az inváziónak, különben a világvége véget ér. A Super Mario Shooting Zombie -ban segíthetsz a hősnek, hogy kiüsse a kísérteteket azokról a helyekről, ahol várhatóan elrejtőztek jobb időkig. Meg kell szerezned az élőholtakat mindenhonnan, minden kéznél lévő tárgy felhasználásával, valamint ricochet a Super Mario Shooting Zombie -ban.