A háborúban az ellenség elsősorban katonai létesítményeket igyekszik megsemmisíteni: repülőtereket, katonai egységeket, lőszerraktárakat. Az Atomic Fighter 2D-ben egy vadászgép irányítását veheted át, hogy megvédd a katonai bázis feletti eget. Az ellenséges támadórepülőgépek és bombázók százada már közeledik felé. Az Ön feladata, hogy megtartsa a védelmet és aktívan támadja az ellenséget az egész fronton. Mozgasd a vadászgépet balra vagy jobbra, távolodva a lövöldözéstől a repülő ellenséges gépek felé, és támadj és lőj magadnak, egyenként megsemmisítve a gépeket. Gyűjts össze különféle bónuszokat menet közben, ezek segítenek megbirkózni a hatalmas számú előretörő ellenséggel az Atomic Fighter 2D-ben.