A távoli világban, ahol minden blokkokból áll, a régész Tom, aki civilizációjának történetét kutatja, él. Amint megtalálta a kártyát, ami a templomhoz vezetett. Felfedezve azt, a hősünk véletlenül aktiválta a csapdákat és felszabadította a templomot őrző zombi katonákat. Most a Blocky Runner játékban el kell rejteni az üldözést. Miután ugrottunk ki az épületből, a karakterünk teljes sebességgel fut majd az út mentén. Útközben különböző akadályokba ütközik. A hős mozdulatait vezérelheti, vagy átugorhatja őket, vagy futtathatja a pártot. Ebben az esetben a hősünknek annyi aranyat kell összegyűjtenie, ami szétszóródott a futás útján.