A távoli jövőben a tudósok megtanultak tárgyakat mikroszkopikus méretre csökkentni. Ma a Spore Hunter játékban úgy döntöttek, hogy küldenek egy pilótát egy speciális repülőgépen, hogy felfedezzék a mikrovilágot. A hősének repülnie kell egy meghatározott útvonalon, és fel kell fedeznie ezt a világot. A spórákból álló lények megtámadják hősünket. A feliratú számok benne lesznek láthatóak. Ez azt jelenti, hogy hány találatot kell tennie a lénynek, hogy elpusztítsa. Okosan manőverezve a fegyverét lőni fogja és elpusztítja a spórákat.
