A Ninja Hands 2 játék második részében továbbra is segítesz a nindzsáidnak a háborúban a különféle ellenfelek ellen, akik meg akarják ölni. A harcosod látható lesz előtted a képernyőn, aki egy adott helyen lesz. Az ellenség távol lesz tőle. A jobb alsó sarokban lesz egy speciális panel ikonokkal. Ha rájuk kattintasz, bizonyos műveletekre kényszerítheted a hőst. Meg kell támadnod az ellenfelet, és harci képességeiddel el kell pusztítanod az ellenséget. Ezért pontokat kapsz a Ninja Hands 2 játékban.
