Az emberek arrogánsan azt hiszik, hogy mindent tudnak, és ezt a magabiztosságot a tudomány fejlődése, valamint a számos felfedezés és találmány megjelenése oltja beléjük. Ez azonban korántsem így van, és az igazán bölcs emberek biztosak abban, hogy az emberiség csak a valódi felfedezések küszöbén áll. De a Hidden Village játékban nem ilyen globális dolgokról fogunk beszélni, hanem egy Emma nevű édes lányról. Korán túl okos, hisz a mágia létezésében, ami azt jelenti, hogy a mesék és a legendák nem fikciók. A falubeli lányt furcsának tartják, de nem fog megváltozni, hogy az általános véleménynek eleget tegyen. Éppen ellenkezőleg, a hősnő egy elveszett falut keres, ahol a legenda szerint mágikus erőkkel rendelkező emberek éltek. Segíts Emmának megtalálni a falut Hidden Village-ben.