A játék hősnője Kubo és a két kard ment keresztül sok veszélyes teszten, mielőtt professzionális nindzsává válna. De még ezt a feladatot is egyedül nem teheti meg. Segítesz egy két kardos lánynak, hogy egy mágikus kockát kísérts a portálra, és örökre elrejtse a gonosz erõitõl. Míg kísérte őt, akkor támadhatsz szörnyeket, elég vérszomjasak és könyörtelenek, használd a fegyveredet és megszüntessed a rakomány veszélyét. Amikor véget érsz, akkor a legnehezebb csatával szembesülsz egy erőteljes démonnal, aki sokkal erősebb, mint a hősnő, de ha taktikát mutatsz, nehézség nélkül legyőzheted.
