A Ninja Monster Killer játékban az ősi Japánba utazunk. A középkorban éltek azok az emberek, akik mágikus erőkkel rendelkeztek. Néhányan erőt alkalmaztak az emberek kárára. Az egyik ilyen bűvész, varázslat és kísérletek révén összeszedte a szörnyek egész levegőjét, amelyet egy különleges műtárgy irányított. Egy bátor ninja utasítást kapott arra, hogy ellopja az objektumot. Most be kell lépnie a várra, és állnia kell a hegyen. Hősünk ösvénye a hegyek tetejére vezető alátámasztásokon fekszik. Ők lesznek a szörnyek. A hős irányítását át kell ugrani, és előre kell lépned.
