Az orvosi vállalatok már régóta kezdik kísérletezni az emberi DNS-sel. A Darwin Legacy játékában a jövőben találja magát, amikor a kísérletek elkezdtek gyümölcsöt viselni és nagyon szomorúak. Gurney Montecristo a történetünk főszereplője. A nagyvállalatok egyikében dolgozik, ami szintén genetikai kísérletekhez kapcsolódik. Együtt vele együtt megpróbálod megállítani a rettenetes X vírus terjedését, ami a tudósok bőrkiütéséből ered. Szükséges a 38 szektorba behatolni, hogy megtaláljuk és megsemmisítsük a kapszulát a vírussal. A tét az emberiség túlélése, segít a karakternek.
