Szinte mindenki hallott az alkímiáról, és kevesen gondolják, hogy az arany valamiféle filozófus kőből hozható létre. Az Alchemist`s Village játék ideiglenesen elhagyja a szkepticizmust, és megismerkedhet a valódi alkimistával, Patricknel, aki egy varázslatos földön él. Egész életét egyetemes képlet keresésére töltötte, és miután elvesztette reményét annak reprodukálására, úgy döntött, hogy a legtehetségesebb tudóshoz fordul, aki Samuel nevû alkímiával foglalkozik. Ehhez el kell mennie a faluba, ahol az alkimisták élnek. De megérkezéskor a hős rájön, hogy az a személy, akinek nagy reményei voltak, halálos beteg, és még beszélni sem tud. De vannak megjegyzései a kutatások eredményéről, amelyeket meg kell találni.
