Az új Puzzle Ball Rotate játékban el kell mennie egy háromdimenziós világba, és segítenie kell a labdákat egy speciális kosárba jutni. A képernyőn előtted játszótér jelenik meg, amelynek közepén egyfajta labirintus található. Egy bizonyos helyen látni fogod a golyóidat. A labirintus alatt egy kosár lesz látható, amelybe ezek az elemek eshetnek. A vezérlőgombokkal elforgathatja a labirintust az űr különböző irányaiba. Mielőtt elhagyná a labirintust, el kell vetnie a golyókat egy bizonyos útvonalon. Amint közel állnak hozzá, öntse őket a kosárba. Amikor az összes golyó eltalálja, pontokat kap, és a játék egy másik, nehezebb szintjére léphet.