Háború tört ki a ninja két rendje között. Te a Ninja Versus Ninja játékban részt veszel ebben a konfrontációban. A játék elején ki kell választanod a karakteredet. Alatta fegyvereket és lőszert kap. Ezt követően hősöd egy bizonyos területen lesz. Ellenfeled a helyszín másik végén lesz. A jelzésre az irányába kell haladnia. Amint közel kerülsz, megkezdődik a párbaj. Sztrájkolhat kardjával vagy dobófegyverrel. Az Ön feladata, hogy a lehető leggyorsabban megölje az ellenséget, és pontokat szerezzen érte. Téged is megtámad. Ki kell kerülnie az ütéseit, vagy el kell akadályoznia a kardjával.
