A távoli jövőben a zombik kataklizmák és háborúk sorozata után jelentek meg a pixelvilágban. Most élő halottak hordái vadásznak a túlélő emberekre. A Pixel Zombies-ban az egyik emberi települést őrzi. El kell pusztítania az irányába haladó zombik hordáit. Az út látható lesz az előtted lévő képernyőn. A zombik különböző sebességgel haladnak az irányába. Meg kell határoznia a legfontosabb prioritásokat és el kell kezdenie rájuk kattintani az egérrel. Így sztrájkolni fog a választott zombikra, és elpusztítani őket. Minden megölt ellenségért kapsz egy bizonyos számú pontot.
