A játékpályákon való futás már régen nem hagyományos, hol sarkúban, hol rúddal, hol lépcsőn futnak, a Balance Run 3D játék pedig még tovább ment. Hősünk a táblán fog mozogni, amely két tömboszlopon található. Az összes akadály leküzdéséhez sárga blokkokat kell gyűjteni az út mentén, de az egyensúlyt be kell tartani. Ha a bal vagy jobb oldali oszlop sokkal lejjebb van, a tábla túlságosan megdől, és a hős egyszerűen lecsúszik, és a Balance Run 3D játék véget ér. A szintek fokozatosan nehezednek, de biztosan.