Sok rejtvényhez minimális logikai gondolkodásra és bizonyos stratégiákra van szükség, és ez alól a Color Dot Link Brain Puzzle sem kivétel. Ennek lényege, hogy az összes többszínű négyzetet összekötjük egymással, és kitöltjük a mezőt vonalakkal. Azonos színű négyzeteket csatlakoztathat. A vonalak nem metszhetik egymást, és nem maradhat üres hely a pályán. A Color Dot Link Brain Puzzle játék hét nehézségi módot kínál, amelyek a mező méretében különböznek egymástól. A mód befejezéséhez össze kell gyűjtenie bizonyos mennyiségű csillagot. A csillagok összege megegyezik a Color Dot Link Brain Puzzle játékban teljesített szintek számával.