A Jelly Links számrejtvény arra készteti, hogy minden szinten kapcsolatot teremtsen a zselés gombok között. Néhány gombon számok találhatók, míg a többi szürke színű, kérdőjellel. A szürke elemekre kell kattintania, hogy a játékszabályok alapján kiválasszon egy számot. Kimondja, hogy nem lehet két egyforma szám egy sorban vagy oszlopban. Csak a szürke gombokon módosíthatja a számokat, a többi fix, a Jelly Linksben nem módosítható. A játék szintjei fokozatosan nehezednek, a mezőterület megnő, és több gomb lesz.
