A Prison Break Lockdown játék hőse életfogytiglani börtönre ítélték, a közelmúltban a büntetést felülvizsgálták, és végrehajtással helyettesítették. Ez meglepetésként ért. A szegény fickót nemcsak a semmiért börtönözték be, hanem kivégzik is. Nyilvánvalóan valaki nagyon befolyásos akar biztosan megszabadulni a fogolytól. Az események ilyen fordulata arra kényszerítette a hőst, hogy gondoljon a menekülésre, és nagyon kevés ideje van. A minap karantént hirdettek és a kivégzést elhalasztották, de hamarosan minden folytatódhat. El kell kezdeni a menekülési terv végrehajtását. A karantén alatt az őrök nem tartják be túlságosan a rendszert, és megpróbálnak nem kóborolni a területen, ami azt jelenti, hogy észrevétlenül be lehet lopózni. Először szálljon ki a cellából, majd az udvaron és a börtönön kívül a Prison Break Lockdown-ban.
