A nindzsáknak új tárgyai vannak a kocka nindzsában való edzéshez – ezek háromdimenziós, többszínű, kocka alakú figurák. Ugrálnak majd, és ügyeljen arra, hogy ne hagyjon ki egyetlen elemet sem, mert a kihagyás a játék végét jelenti. Ha egy rácsból álló kockát lát, ne hagyja ki, mert lassítja az időt. Megsemmisítése után. Minden tárgy leesik, mint a lassított felvételnél, és megpihenhetsz egy kicsit, mert a jövőben az objektumok sebessége és száma folyamatosan nő a Cube Ninja-ban.