A repülõhalak nem léteznek a természetben, de néhány hal kiugrik a vízből, és repülnek. Halunk, a játék hősnője, a Flapy Fish nem különbözik az ilyen képességektől, ő egy hétköznapi hal, amely az óceán mélyén úszik, és megpróbál túlélni egy durva víz alatti világban. Élete nehéz időszakában találkozol vele. A halak elhagyták szülőhelyüket, hogy valami jobbat találjanak. Ahol a közelmúltig élt, a katonai műveletek megkezdődtek, és ez nyugtalan lett. Ezért a halak hosszú utat folytattak. Segíteni fogsz neki az akadályok leküzdésében, ahogy a víz alatti város romjai felmerültek, és amelyet ügyesen meg kell határozniuk a flapy halakkal.
