Egy fiatal fiú, Kyoto csatlakozott a ninja harcosok titkos parancsához. A hegyekbe küldték egy különleges templomba, ahol az Akadémia található, ahol az összes kezdő háborút kiképzik. Ma hősünk edzést tart, és Ön segít abban, hogy levezesse őt a Ninja Academy játékában. A képernyőn előtted meglátod karakteredet, aki a templom udvarán áll. Alatta egy speciális vezérlőgombokkal ellátott panel található. Segítségével irányítani fogja hősének cselekedeteit. Tárgyak jelennek meg előtte különböző oldalakról. A hős vezetésével kéz vagy láb segítségével pontos ütéseket kell rájuk gyakorolnia. Minden pontos találatod bizonyos számú pontot hoz. Az ütések gyakorlása után folytatja a különféle technikák kidolgozását.
