A klónozást több mint egyszer vagy kétszer használták a játékvilágban, a problémák megoldásának megoldására. A Quantum Split ezt az elvet is használja. A fekete szín pixel hőse a labirintus platformjába esett, és hogy kiszabaduljon, saját klónjára lesz szüksége. A kezdeti szinteken nincs rá szükség, a hős átadja az összes akadályt. Tudja, hogyan kell magasra ugrani, és az akadályok legyőzése nem nehéz. A veszélyes csapdák azonban tovább jelennek meg, amely egy nagy piros gomb megnyomásával kiküszöbölhető. Ehhez klónra lesz szükség. Kattintson az R gombra, és megjelenik egy fehér klón. Megismétli prototípusának korábbi műveleteit kvantum -osztással.
