A fiatal srác, Thomas gyermekkora óta szereti az olyan sportot, mint a gimnasztika. Karakterünk gyakran otthon szervez kisebb edzéseket, hogy formában tartsa magát és megőrizze teste rugalmasságát. A Flex Runban ma csatlakozik hozzá az egyik ilyen edzésen. Ön előtt a képernyőn látni fogja a karakterét, aki a háza egyik szobájában lesz. A karakterednek egy meghatározott útvonalon kell futnia. Útközben háztartási cikkek és bútorok jelennek meg. A karaktered ügyes irányításával segítened kell neki, hogy elkerülje az ezekkel a tárgyakkal való ütközést. A Flex Run-ban minden sikeres kitérésed meghatározott számú pontot kap.
