Egy reggel Mario arra ébredt, hogy valami megakadályozta abban, hogy a hátán feküdjön. Némi növedéket találva meglehetősen megijedt, és azonnal magához tért a félelemtől, és a tükörhöz rohant, hogy megnézze. Ami mögötte megjelent. A kis szárnyakat látva a hős megdöbbent és eleinte még fel is háborodott Flappy Marióban. De aztán, átgondolva, úgy döntött, hogy a repülési képesség sok előnnyel jár. Nem kell többé a közlekedésről gondoskodnia, sokkal gyorsabban tudja leküzdeni a levegőben átvezető utat, mint egy motorkerékpáron vagy autón. Már csak meg kell tanulnia repülni, és ebben segíteni fog neki, ha belép a Flappy Mario játékba.