A Counter-Strike: Reboot játék hősének tizenkét küldetésben kell részt vennie a segítségeddel. Mivel a tartalmat szigorúan titokban tartják, a célok az előző küldetés teljesítése során derülnek ki. Az elsőt Alfának hívják, és az Ön feladata, hogy visszaverje a terroristák támadását, akik el akarják foglalni a bázisodat. Más küldetések során más feladatokat kell végrehajtania, mint például: túszok kiszabadítása, terrorista bázisok megsemmisítése, aknák eltakarítása stb. Minden küldetés időben korlátozott, gyorsan és hatékonyan kell megoldania a problémákat a Counter-Strike: Rebootban.
