A Nano War játék a sejtek belső világába kalauzol el. Ott egy szerencsétlenség történt – az anyasejtet vírusok támadták meg, és fertőzött sejteket kezdett termelni. Néhány egészséges sejt úgy döntött, hogy megküzd az anyjukért, és arra kérnek, hogy segíts nekik ebben. Vegyen részt egy rövid tanfolyamon, hogy megtanulja, hogyan tovább. Vegye figyelembe az erő szintjét, ezt számértékek jelzik, és irányítsa a sejteket a tér meghódítására. Kezdje el a semleges szürke sejtek befogását, hogy fokozatosan növelje hadseregét a nanoháborúban, és így haladjon a győzelem és az egész szervezet gyógyulása felé. A gyomorral kezded.